在現代醫學不斷探索高效治療方案的進程中,非酒精性脂肪性肝炎(NASH)的治療難題始終備受關注。決明子作為傳統中藥材,在諸多疾病治療中展現出獨特潛力。2025年,圍繞決明子的研究取得新進展,科研人員藉助網絡藥理學、分子對接和分子動力學模擬等先進技術,深入探究其治療NASH的作用機制,為決明子在醫藥領域的應用開拓新方向。
科研人員利用中藥系統藥理學資料庫與分析平台(TCMSP),以口服生物利用度且 「類藥性≥0.18」 為篩選條件,從決明子中篩選出 13 個活性成分,包括 1,7 - 二羥基 -2,3,8 - 三甲氧基 -6- 甲基蒽 -9,10- 二酮、大黃酸、豆甾醇等。隨後,通過 TCMSP 資料庫和有機小分子生物活性資料庫(PubChem)獲取這些成分的 SMILES 信息,缺失部分藉助紐普生物在線工具轉換。再利用 Swiss Target Prediction 資料庫,以 「Homo sapiens」 為檢索條件、「probability>0」 為篩選標準,預測潛在靶點,經去重後得到 247 個決明子活性成分潛在靶點蛋白。同時,以 「NASH」 等為關鍵詞,在 GeneCards、DisGeNET、OMIM 和 TTD 等 4 個資料庫檢索 NASH 疾病相關靶點,經篩選、合併與去重,最終獲得 2634 個 NASH 相關靶點。將決明子靶點與 NASH 靶點錄入 Venny 2.1 在線軟體繪製韋恩圖,確定 102 個交集靶點,這些靶點成為決明子治療 NASH 的潛在靶點。
《2025-2030年全球及中國決明子行業市場現狀調研及發展前景分析報告》指出,將決明子活性成分及其作用於 NASH 的 102 個潛在靶點導入 Cytoscape3.10.0 軟體,構建 「決明子 - 成分 - 靶點 - NASH」 關係網絡圖。圖中綠色節點代表活性成分,藍色節點代表交集靶點,通過節點間連線、大小和顏色判斷成分發揮作用的可能性,確定膽固醇、豆甾醇和大黃酸為決明子治療改善 NASH 的核心成分。將102個交集靶點輸入 STRING 資料庫構建蛋白質 - 蛋白質相互作用(PPI)網絡,再導入 Cytoscape 3.10.0 軟體優化分析。依據度值篩選出前 10 個關鍵靶點,分別是表皮生長因子受體(EGFR)、熱休克蛋白 90α 家族 A 類成員 1(HSP90AA1)、基質金屬蛋白酶 - 9(MMP9)等,這些關鍵靶點在決明子治療 NASH 過程中可能發揮重要作用。
利用 DAVID 分析平台對決明子與 NASH 的 102 個交集靶點進行富集分析,並通過微生信平台繪圖。GO 功能富集分析得到 402 個條目(P<0.05),在生物過程層面,前 3 種分別是磷酸化修飾、胞內受體信號通路和細胞凋亡過程的負調控;細胞組分層面,前 3 種為高分子複合物、胞質組分和細胞質膜結合的囊泡;分子功能層面,前 3 種是 RNA 聚合酶 Ⅱ 轉錄因子活性、酶結合和蛋白酪氨酸激酶活性。這表明決明子治療 NASH 是多種生物過程、細胞組分及分子功能共同作用的結果。
KEGG 富集分析篩選出 123 條信號通路(P<0.05),決明子活性成分主要通過腫瘤相關通路、內分泌抵抗、受體激活、EGFR 通路、非酒精性脂肪肝病相關通路、細胞凋亡和 PI3K - Akt 等通路發揮作用。關鍵靶點中,EGFR 落在 EGFR 相關通路,BCL2 與 CASP3 落在凋亡相關通路,PIK3CA、PIK3CB 和 PIK3CD 落在 PI3K - Akt 信號通路,說明決明子通過這些信號通路參與 NASH 治療。
從 PubChem 資料庫下載決明子核心成分 sdf 文件,經 OpenBabel 軟體轉化為 mol2 格式;從 PDB 資料庫下載關鍵靶基因編碼的受體蛋白晶體結構,用 Pymol3.0.3 軟體處理後保存為 PDB 格式。利用 AutoDock4.2.6 軟體完成分子對接,將結果轉化為 PDB 格式並通過 Pymol3.0.3 軟體可視化。將決明子有效成分度值前 5 的成分與 PPI 網絡中度值前 5 的靶蛋白對接,結果顯示,大黃酸、9,10 - 二羥基 -7- 甲氧基 -3- 亞甲基 - 4H- 苯並 [g] 異色烯 -1- 酮和 1,7- 二羥基 -2,3,8- 三甲氧基 - 6- 甲基蒽 -9,10- 二酮與靶蛋白 EGFR 親和力最強,膽固醇和豆甾醇與 HSP90AA1 親和力最強,驗證了 EGFR 和 HSP90AA1 為關鍵靶蛋白。
針對大黃酸 - EGFR 複合物進行分子動力學模擬,採用 Gromacs2022 軟體、Amber99sb - ildn 蛋白力場和 GAFF 小分子力場,添加水和離子平衡體系後分析模擬軌跡。結果顯示,該複合物迴轉半徑穩定,均方根偏差在模擬後期趨於穩定,表明體系達到平衡;EFGR 部分殘基波動顯著,大黃酸和 EGFR 可形成氫鍵,平均數量為 1.85115±0.96996;結合自由能分析表明,疏水作用和靜電能利於結合,極性溶劑不利於結合,總自由能為 (-19.4±6.81) kcal・mol⁻¹,說明大黃酸與 EGFR 能形成穩定結合。
本研究通過網絡藥理學、分子對接和動力學模擬等技術,系統探究決明子治療NASH的作用機制。證實決明子具有多成分、多靶點、多通路治療 NASH 的特性,膽固醇、豆甾醇和大黃酸是核心成分,EGFR和HSP90AA1是潛在最佳靶點。決明子可通過腫瘤相關通路、胰島素抵抗、EGFR 通路、細胞凋亡和 PI3K - Akt 通路等多種途徑干預改善 NASH,且大黃酸與EGFR能形成穩定結合。然而,本研究主要基於生物醫學數據預測和潛在分子機制分析,缺乏直接實驗數據支撐。未來,還需開展更多臨床和基礎實驗,利用高通量測序及多種分子生物學手段,在體內外水平進一步驗證決明子治療NASH的作用機制,為決明子在NASH治療領域的應用提供更堅實的理論基礎和實踐依據,推動決明子相關醫藥研究的發展。